考馬斯亮藍法測蛋白質含量的優點是：
（1）靈敏度高，據估計比Lowry法約高四倍，其zui低蛋白質檢測量可達1mg。這是因為蛋白質與染料結合后產生的顏色變化很大，蛋白質－染料復合物有更高的消光系數，因而光吸收值隨蛋白質濃度的變化比Lowry法要大的多。
（2）測定快速、簡便，只需加一種試劑。完成一個樣品的測定，只需要5分鐘左右。由于染料與蛋白質結合的過程，大約只要2分鐘即可完成，其顏色可以在1小時內保持穩定，且在5分鐘至20分鐘之間，顏色的穩定性。因而*不用像Lowry法那樣費時和嚴格地控制時間。
（3）干擾物質少。如干擾Lowry法的K、Na、Mg2離子、Tris緩沖液、糖和蔗糖、巰基乙醇、EDTA等均不干擾此測定法。
考馬斯亮藍法測蛋白質含量的缺點是：
（1）由于各種蛋白質中的和芳香族氨基酸的含量不同，因此Bradford法用于不同蛋白質測定時有較大的偏差，在制作標準曲線時通常選用g—球蛋白為標準蛋白質，以減少這方面的偏差。
（2）仍有一些物質干擾此法的測定，主要的干擾物質有：去污劑、TritonX-100、十二烷基硫酸鈉（SDS）和0.1N的NaOH。（如同0.1N的酸干擾Lowary法一樣）。
（3）標準曲線也有輕微的非線性，因而不能用Beer定律進行計算，而只能用標準曲線來測定未知蛋白質的濃度。
