血球計數板被用以對人體內紅、白血球進行顯微計數之用，也常用于計算一些細菌、真菌、酵母等微生物的數量，是一種常見的生物學工具。
使用血球計數板計數時，先要測定每個小方格中微生物的數量，再換算成每毫升菌液(或每克樣品)中微生物細胞的數量。
1.視待測菌懸液濃度，加無菌水適當稀釋(斜面一般稀釋100倍)，以每小格的菌數可數為度。
2.取潔凈的血球計數板一塊，在計數區上蓋上一塊蓋玻片。
3.將菌懸液搖勻，用滴管吸取少許，從計數板中間平臺兩側的溝槽內沿蓋玻片的下邊緣滴入一小滴(不宜過多)，讓菌懸液利用液體的表面張力充滿計數區，勿使氣泡產生，并用吸水紙吸去溝槽中流出的多余菌懸液。
4.靜置片刻，使細胞沉降到計數板上，不再隨液體漂移。放置于顯微鏡的載物臺上夾穩，找到計數區后，再轉換高倍鏡觀察并計數。
5.計數時若計數區是由16個中方格組成，按對角線方位，數左上、左下、右上、右下的4個中方格(即100小格)的菌數。如果是25個中方格組成的計數區，除數上述四個中方格外，還需數1個中方格的
菌數(即80個小格)。為了保證計數的準確性，避免重復計數和漏記，在計數時，對沉降在格線上的細胞的統計應有統一的規定。如菌體位于大方格的雙線上，計數時則數上線不數下線，數左線不數右線，以減少誤差。即位于本格上線和左線上的細胞計入本格，本格的下線和右線上的細胞按規定計入相應的格中。
6.對于出芽的酵母菌，芽體達到母細胞大小一半時，即可作為兩個菌體計算。每個樣品重復計數2-3次(每次數值不應相差過大，否則應重新操作)，按公式計算出每mL(g)菌懸液所含細胞數量。
7.測數完畢，取下蓋玻片，用水將血球計數板沖洗干凈，切勿用硬物洗刷或抹擦，以免損壞網格刻度。洗凈后自行晾干或用吹風機吹干，放入盒內保存。
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