DyLight 594是一種橙紅色熒光團，其zui大吸收波長在593nm，相應的zui大發射波長是618nm。DyLight熒光染料是通過將磺酸酯加成到、呫噸類 （如FITC和羅丹明）以及花箐素類熒光染劑上而成，磺酸酯使DyLight帶負電荷并呈親水性。與傳統的熒光團，如FITC、羅丹明以及Cy3和Cy5 等相比，DyLight熒光染料具有較寬的激發和發射波段，幾乎覆蓋了所有的可見光區域，包括藍色、綠色、黃色、橙色、紅色，以及近紅外和遠紅外波段，因 此可用于大部分熒光顯微鏡以及遠紅外成像系統。并且與傳統的熒光團相比，具有發光亮度更強，靈敏度更高，背景更低的優勢，同時其對pH的穩定性更好，發光 也更持久，因此更適合于拍照。DyLight熒光熒光染料作為熒光顯微鏡、細胞生物學和分子生物學內的生物分子、細胞和組織標記物，可應用于生物技術和研 究等眾多領域。
Cy2耦聯基團激發波長為492nm，發光為波長510nm的綠色可見光。Cy2和FITC使用相同的濾波片，但是要避免使用含有磷酸化的苯二胺的封片劑，因為這種抗淬滅劑和Cy2反應，在染色片儲存后會導致熒光微弱和擴散。Cy2屬于花菁類染料 （Cyanine Dyes），常見的Cy系列染料主要包括有Cy2、Cy3、Cy5等，能與細胞內蛋白質結合。這類染料的熒光特性與傳統熒光素類似，但水溶性和對光穩定性較強，熒光量子產率較高，對pH等環境不敏感。常用于多重染色。與FITC相比，Cy2的熒光強度更大，光穩定性和抗萃滅性更好。
FITC（Fluorescein Isothiocyanate，異硫氰酸熒光素）純品為黃色或橙黃色結晶粉末，易溶于水和酒精溶劑。FITC分子量為389.4，zui大吸收光波長為 490～495nm，zui大發射光波長為520～530nm，呈現明亮的黃綠色熒光。FITC在冷暗干燥處可保存多年，是目前應用zui廣泛的熒光素。由于 FITC是小分子化合物，每一個抗體可標記幾個FITC分子，IgM通常用小分子的熒光素標記，如FITC、Cy3/5、Texas Red等。然而FITC的zui大缺點是淬滅快，因此要和抗淬滅劑一起使用。FITC性質穩定，能與蛋白質結合，是檢測組織細胞內蛋白質zui常用的熒光探針。它 還能標記抗體，可用于免疫組織化學單染或多重染色。FITC熒光二抗主要優點是人眼對黃綠色較為敏感，通常切片標本中的綠色熒光少于紅色。缺點是在光照下 易淬滅，易受自發熒光影響。
Cy5zui大激發光波長為649nm，zui大發射光波長為680nm，呈紅色熒光。Cy5屬于花菁類染料（Cyanine Dyes），常見的Cy系列染料主要包括有Cy2、Cy3、Cy5等，能與細胞內蛋白質結合。這類染料的熒光特性與傳統熒光素類似，但水溶性和對光穩定性較強，熒光量子產率較高，對pH等環境不敏感。常用于多重染色。Cy3可以和熒光素一起作雙標。Cy3還可以和Cy5一起在共聚焦顯微鏡實驗中作多標記。Cy3和Cy5比其他的熒光團探針要更亮，更穩定，背景更弱。由于Cy5的zui大發射波長為680nm，很難用裸眼觀察，而且不能使用高壓汞燈作為理想的激發光源，因此，使用普通熒光顯微鏡時，不推薦使用Cy5。通常觀察Cy5時需使用激光掃描共聚焦顯微鏡。
TRITC（Tetramethyl Rhodamin Isothiocyanate，四甲基異硫氰酸羅丹明）是羅丹明的一種衍生物之一，呈紫紅色粉末，較穩定。羅丹明的衍生物還包括Rhodamine Red-X（RRX）, Texas Red（TR）等。這些羅丹明衍生物的耦聯基團具有不同的吸收波長 （550, 570, 596nm）和zui大發射波長（570, 590, 620nm）。TRITC熒光素能與細胞內蛋白質結合，比FITC穩定性好，在生理條件下對pH值變化不敏感，熒光強度受自發熒光干擾小。TRITC的zui 大激發光波長為550nm，zui大發射光波長為620nm，呈橙紅色熒光，與FITC發出的黃綠色熒光對比鮮明，常用于免疫熒光組織化學雙重染色。因其熒光 淬滅慢，也可用于單獨標記染色。需要注意的是，因為FITC和PE可以被氬燈的488nm波長激發, 在流式細胞儀中用FITC作雙標，另一種用藻紅蛋白（PE）耦聯基團要比羅丹明好。
