磁力泵是將泵的傳動軸之前的部分全部做在一個密封的腔體能內，傳動聯軸器是通過磁力傳動，有內磁缸、外磁缸、隔離套等，電機為普通電機。
屏蔽泵是將泵和電機都裝在一個密封腔內。電機是特制的，電機轉子和定子線圈通過屏蔽套與介質隔離，電機軸和泵軸是一體的，屏蔽泵的效率相對較高，但修理十分困難。磁力泵受磁體磁性的限制，效率較低，維修相對容易，這兩種泵目前的容量都較小。
1、從經濟性來說：屏蔽泵價格高，配件價格也高，運行費用也相對高點，磁力泵相對比較便宜，
2、從可從靠性：從安全的角度來說，屏蔽泵比磁力泵要安全可靠些。
3、從壓力來說：屏蔽泵的設計壓力要高于磁力泵。
4、從泄漏的方面來說：在化工、石化、醫藥等行業輸送易燃、易爆、易揮發、有毒、有腐蝕以及貴重液體時，要求泵只能微漏甚至一滴不漏。磁力泵和屏蔽泵在結構上，只有靜密封而無動密封，輸送液體時都能保證一滴不漏。
5、從介質的溫度來說：屏蔽泵略勝，屏蔽泵在輸送高溫介質時，不存在脫磁現象，而磁力泵則會脫磁。
